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anruokun 发表于 2015-11-10 04:53:57 | 显示全部楼层 |阅读模式

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就一道题
使用bit 比较两个string的相似性.鏈枃鍘熷垱鑷1point3acres璁哄潧

我不会做 鏉ユ簮涓浜.涓夊垎鍦拌鍧.

类似于这样的
use strict;
use warnings;

my $strA = 'ATGNCNC';
my $strB = 'ATGACNN';
my $strC = 'TTGACNN';

print $strA, (match ($strA, $strB) ? ' eq' : ' ne'), " $strB\n";
print $strA, (match ($strA, $strC) ? ' eq' : ' ne'), " $strC\n";

.鏈枃鍘熷垱鑷1point3acres璁哄潧
sub match {
    my ($mask1, $mask2) = @_;
    my ($str1, $str2) = @_;
   
    $mask1 =~ tr/NATGC/0\xFF/;
    $mask2 =~ tr/NATGC/0\xFF/;
    $mask1 &= $mask2;
    $str1 ^= $str2;
    $str1 &= $mask1;
   
    return $str1 !~ /[^\x00]/;
}v
zfrancica 发表于 2016-10-4 10:04:06 | 显示全部楼层
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Warald_一亩三分地
...完全没看懂..
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