来讨论一下computational biology and bioinformatics

提供一个样本，CS出身，在一个普通大学读CS PhD，做生物信息，文章一般。毕业就找到教职，现在学校帮办身份。路都是自己走出来了。

ndsu 发表于 2018-10-31 04:33
提供一个样本，CS出身，在一个普通大学读CS PhD，做生物信息，文章一般。毕业就找到教职，现在学校帮办身份 ...

找到哪里的教职了啊？

nsc 发表于 2018-10-30 09:58
谢谢cz的分享！
找教职还要身份吗？一般专业的教职好像都给办身份啊。是因为这个computational biology  ...

觉得戾气有点重啊，教职和身份没有关系啊，当然有会好，不然funding有些不好申请，但是能不能申请到教职和身份基本没有关系。

Luptior 发表于 2017-4-23 12:27
本科cs的bioinfo有什么优势么？

本科cs准备申bioinfo 的PhD

楼主您好 我也是cs准备转bioinformatics的请问可以加您微信交流嘛

窦婉莹 发表于 2021-4-19 05:29
楼主您好 我也是cs准备转bioinformatics的请问可以加您微信交流嘛

我后来申了CS PhD

biomedicineman 发表于 2017-11-18 11:56
我就是half-bioinfor PhD；我通过NGS发现了我们领域XXX famous disease长期以来没有被发现的致病的tandem r ...

不是很懂，既然找到没被发现的variant，为什么做benchwork会做到疯掉？如果是很显著的，那实验验证应该没有太大问题，如果做不出来，确定不是false discovery？

还有既然想受CS训练为什么要做bioinformatics...

ML/DL的确很难做，做成功的基本都大机构，但是bioinfo/comp bio不讨论生物data，不跟biologists讨论，那是要干什么。。闭门造车？

Luptior 发表于 2021-4-19 23:13
我后来申了CS PhD

可以冒昧的问一下您为什么没有选bioinformatics嘛，因为我现在也在面临这个问题，我自己本身非常喜欢bioinformatic但是真的担心自己把路走窄了，没了退路

窦婉莹 发表于 2021-04-19 18:51:36
可以冒昧的问一下您为什么没有选bioinformatics嘛，因为我现在也在面临这个问题，我自己本身非常喜欢bioinformatic但是真的担心自己把路走窄了，没了退路

专门bioinfo的program太偏生物，计算算法的东西很少，很多导师是非常experimental science的背景的，到后来都是在研究现象…我不知道这样讲你明不明白就是还是太生物了

我觉得CS里挑 做HPC，Machine Learning之类的做一些Bioinfo的application就比较好。 外加太生物的确不好找工作，最后可能去业界也要做做data science之类的

Luptior 发表于 2021-4-20 10:03
专门bioinfo的program太偏生物，计算算法的东西很少，很多导师是非常experimental science的背景的，到后 ...

我明白了 十分感谢您 我可能还是要再多想想

maruka 发表于 2021-4-20 04:36
不是很懂，既然找到没被发现的variant，为什么做benchwork会做到疯掉？如果是很显著的，那实验验证应该没 ...

不知道你是不是做过benchwork的，生物实验角度哪里是个个都是显著差别？一大堆擦边球/subtle change的。投入了大量成本，怎么招都要继续做下去。这就是bench vs computer的区别。

另外我也是在bioinfor学习过程中对CS有兴趣的。更多的人，说的难听点，是希望改行CS但没有头绪，没有资本，所以先做个bioinfor来过渡一下。那些一把年纪有家有娃的postdoc怎么可能像年轻人说改行就改行，这个世界上的事情哪里都那么容易的？