CS本申请Computational Biology是否是跳坑？

Hazelsuko 发表于 2018-3-20 10:54
我感觉我们俩遇到的可能不是同一个问题。我现在所做的是将CS知识transfer到biomedical应用中，所需要补充 ...

我是想从统计转到neuroscience，你的回答给我的感觉像是要做一些应用性的东西。我自己认为以应用为导向的或许去公司会更加不错？否则读博期间就有一种给导师打工的感觉。但是你也说着眼点是在算法层面，那为什么不做统计、或者机器学习呢？我不是很明白。另外CS本科学的内容是不是主要是一些汇编、操作系统的东西，算法的课程是不是就一两门（这个我是听说的，不是特别了解，如有不对，请楼主指正）。在我看来，反倒是统计更适合做Computation Biology :)  

补充内容 (2018-3-20 23:25):
I mean, 楼主更应该补一些统计的知识。

Hazelsuko 发表于 2018-3-20 15:58
方便问下层主的背景和研究方向嘛

我做计算物理方向的，作材料和相变什么的，小的蛋白也算过。主要是开发新的算法，应用做的不多。这几年ml火，这方向的PI也跟风把研究往上靠，认识的人里有科研用到ml的，但找工作还是看刷题。绝大多数情况技术面时对方也只是礼貌性对你的研究感兴趣，其实人家根本不在乎。至于hr的话，发不发电面就是看所在系和所在学校。计算方向找工作和面试和同等排名学校或差一点学校的cs或统计方向差远了。能沾边的相关工作本来就没那么多，逐年来又被越来越大的PhD毕业生人群瓜分，入行门槛只会越来越高。差一点专业的PhD或者那些天坑专业的真是温水煮青蛙。

我刚来读书的时候每年h1b配额还不用抽签，facebook还在扩张，同期过来读master的小伙伴毕业基本都是简单刷刷题就进google，facebook。过了几年形式差一些了，但中途quit的小伙伴还是有amazon保底的。如今就呵呵了，flag进入平稳发展期不需要大量招人了，新一代崭露头角的独角兽遥遥无期，要sponsorship的工作更难找了。

这些年除了cs之外，基本所有其他专业，包括统计，的PhD说实话是供大于求的，PI拿到funding就多招人做科研，至于毕业之后如何他们也只是礼貌性表示关心。科研有funding并不代表有就业岗位，如果能忍受拿地里抖offer的1/3的工资去做4-6年post doc，去等一个遥遥无期可能一辈子也排不到的教职另说。而且你发现同期quit去转cs或quant的小伙伴早都在大公司有一官半职，有h1b或绿卡，买房结婚了。


补充内容 (2018-3-21 00:38):
将来读什么专业不要参考教授意见，他们都活在象牙塔的肥皂泡里。尤其是cs的教授，他们同学和自己系里的学生都是毕业后高薪，他们根本不理解其他专业的绝望。

realdavid 发表于 2018-3-20 23:21
我是想从统计转到neuroscience，你的回答给我的感觉像是要做一些应用性的东西。我自己认为以应用为导向的 ...

yes，这正是我所担心的。我选的track是计算机科学，所以也修了统计、数值分析一类的课程，但底子还不算特别好。虽然现在DL可以刷效果，但我也认可之后真正profound的研究应该有更强的数理支撑，谢谢你的建议，我觉得很有帮助:)

哈哈居然在帖子里看到了熟人

感觉楼主对基因啊蛋白质什么的感兴趣很难得啊！我一个生物背景的就是对这些too bio的东西不很感兴趣反而对医疗过程的数据比较感兴趣

其实可以考虑一下BMI项目（医学院），据我某利益相关校phd在读的前辈说学术界tier 1的有大S，vandy（不收直博），哥大，UW，UCSF，Utah还有另一个前辈题目的匹兹堡
通常这个项目里cs和生物出身的教授一半一半，但学生也是如此，也许你会比bio的学生有优势呢？（比如匹兹堡医学院就面试了我cs的朋友而脆聚了bio的我
并且如果你去跟着cs的教授的话应该还是不会过于bio的？跟着bio的老师的话我觉得你肯定会被老师抓去补bio知识的，我在组会上见过老师不厌其烦地和工科出身的学生解释某些基因片段的生物意义……
同时每个学校侧重点不一样，但是基本就是医疗/健康/生物分子/流行病+ML/HCI的各种组合
不过有个大坑就是这些学校都不给国际生任何guaranteed funding，只能收到ad，但我利益相关校的前辈第二年开始被脸帅pub好学历高又贴心老板包养啦哈哈

当然cs phd找做医学相关的老师也不错，不过你要和其他cs选手争夺phd录取，而不是bio选手了
在这里顺便提几个也许你会感兴趣的项目：
McGill的CS有bioinformatics track，虽然叫bio但我感觉凡是BMI做的不大的学校都不会细分生物/医学
Gatech有机器学习 x BME 的phd
Emory的BMI是cs/信息和医学院交叉的，听说特别特别特比有钱
psu的交叉学科ist项目有做BMI的老师
最后就是捡走了我的匹兹堡交叉学科人工智能isp项目，和bmi那边share一套做医疗和AI的faculty，特别生物的好像就没share了，然后对国际生来说通常比bmi好录一些

楼主加油，祝好运~

补充内容 (2018-4-28 18:25):
我觉得生物和医疗还是有很大区别的，你想想你究竟是想研究基因和疾病的机理呢，还是如何利用医疗过程产生的数据优化治疗呢，甚至是保险相关的计算呢？

补充内容 (2018-4-28 18:28):
以及不靠谱的猜测：bioinfo和comp bio的钱还是蛮多的因为最后也许是一个bio项目big picture的一部分，可以从bio拿钱；医疗健康相关的相对funding较少。

补充内容 (2018-4-28 18:38):
楼主对图像感兴趣的话我记得UCSD有个专门的图像项目？BMI的话有一个NLM BMI training program，里面收录的学校基本就是这个方向做的比较多的学校啦

我也产生了这个疑问😢想问lz现在的想法是咋样呀