CS本申请Computational Biology是否是跳坑？

CS大三，即将参加19Fall的申请，背景见 http://www.1point3acres.com/bbs/thread-348032-1-1.html
因为一些情怀的原因，喜欢并且正在做医学相关的research，而且很希望能用自己CS的背景去解决这些问题。之后想申请Computational Biology方向的PhD，做一些基于计算的更底层的基因、蛋白level的研究，现在也在补一些生物方向的网课。然而一直被劝不要跳生物坑，所以想来问下已经就业的大家，CB毕业找工行情怎么样？有什么推荐的CB项目或校呢？

加米加米，感激不尽......

很坑，不建议转。如果非常想做有些学校cs系的教授在做这个方向，建议去申请cs phd，然后research做这个方向。年轻气盛往坑里跳有后悔的那天

Hazelsuko 发表于 2018-3-20 15:58
方便问下层主的背景和研究方向嘛

我做计算物理方向的，作材料和相变什么的，小的蛋白也算过。主要是开发新的算法，应用做的不多。这几年ml火，这方向的PI也跟风把研究往上靠，认识的人里有科研用到ml的，但找工作还是看刷题。绝大多数情况技术面时对方也只是礼貌性对你的研究感兴趣，其实人家根本不在乎。至于hr的话，发不发电面就是看所在系和所在学校。计算方向找工作和面试和同等排名学校或差一点学校的cs或统计方向差远了。能沾边的相关工作本来就没那么多，逐年来又被越来越大的PhD毕业生人群瓜分，入行门槛只会越来越高。差一点专业的PhD或者那些天坑专业的真是温水煮青蛙。

我刚来读书的时候每年h1b配额还不用抽签，facebook还在扩张，同期过来读master的小伙伴毕业基本都是简单刷刷题就进google，facebook。过了几年形式差一些了，但中途quit的小伙伴还是有amazon保底的。如今就呵呵了，flag进入平稳发展期不需要大量招人了，新一代崭露头角的独角兽遥遥无期，要sponsorship的工作更难找了。

这些年除了cs之外，基本所有其他专业，包括统计，的PhD说实话是供大于求的，PI拿到funding就多招人做科研，至于毕业之后如何他们也只是礼貌性表示关心。科研有funding并不代表有就业岗位，如果能忍受拿地里抖offer的1/3的工资去做4-6年post doc，去等一个遥遥无期可能一辈子也排不到的教职另说。而且你发现同期quit去转cs或quant的小伙伴早都在大公司有一官半职，有h1b或绿卡，买房结婚了。


补充内容 (2018-3-21 00:38):
将来读什么专业不要参考教授意见，他们都活在象牙塔的肥皂泡里。尤其是cs的教授，他们同学和自己系里的学生都是毕业后高薪，他们根本不理解其他专业的绝望。

Hazelsuko 发表于 2018-3-20 10:54
我感觉我们俩遇到的可能不是同一个问题。我现在所做的是将CS知识transfer到biomedical应用中，所需要补充 ...

. 1point3acres.com 楼主，我本科是BME，科研做的BMI的metabolomics，我觉得可以回答一下这个问题。

BME有很多方向而且方向很广，生物材料，力学，电器，图像处理，还有纯生物都有涉及。科研圈里funding都很足。但是就业的话主要看计算的成分多不多，比较好的就是学些电路设计然后去做医疗器械的EE。或者就是上面说过的图像处理，主要靠的是CS的知识。

在我来看，BMI和BME有交集，但是也各有独特的地方。我本科因为对CS的一些内容感兴趣，所以自学了一些编程（R，Python，MySQL），去了我们学校的BMI系做科研。BMI主要是组学（Omics data）,就是基因组，转录组，代谢组（我做这个），微生物组。更像是data science 在生物方向的分支，科研都是在data mining一些生物数据，基本没有wet lab。不过和BME一样，computational biology的成分都有，BMI一般都是用统计里的模型（ML什么的）。我在BME做的模型，一般都是有些生物背景，加上CAD再加上一堆ODE什么的，针对某个生物现象...

楼主真的喜欢的话, 建议楼主去鼓捣CNN做医学图像处理哇
去申CB(尤其做底层)的话就业真的会比CS差比较多, 医学图像处理算是其中最有前景的
(目测很多视觉公司现在都开始在这个领域部署)

赞同楼上，医学图像处理和人工智能结合很多，是现在cs在医学方面的应用的最热门的了。
感觉楼主如果感兴趣，可以申请biomedical informatics或者bme这两个专业，和医学图像处理这个方向相关度最高

ericdu1996 发表于 2018-3-18 20:56
赞同楼上，医学图像处理和人工智能结合很多，是现在cs在医学方面的应用的最热门的了。
感觉楼主如果感兴趣 ...

嗯嗯谢谢！想问下bioinformatics和BME的主要差别在哪里呢？

GabrielaSong 发表于 2018-3-18 19:58
楼主真的喜欢的话, 建议楼主去鼓捣CNN做医学图像处理哇
去申CB(尤其做底层)的话就业真的会比CS差比较多,  ...

但感觉目前四大都在部署computational genomics方向的lab，不知道这块前景如何.....

Hazelsuko 发表于 2018-3-19 19:23
嗯嗯谢谢！想问下bioinformatics和BME的主要差别在哪里呢？

bioinformatics里面比较产业化的就是测序相关的了，太偏生物啦，这个在国外的情况不太了解，国内的话就是技术员啦，而且薪水不是太高（当然比纯生物要高很多啦，不过远不如cs）
bme里面包含了医学图像处理，然后我说的biomedical informatics基本是bioinformatics和bme的结合。
（三者关系大概是bmi = bioinformatics + bme）

补充内容 (2018-3-19 20:00):
所以我说想做医疗影像处理，可以申请bmi和bme专业。bioinfo不包含医疗影像的

ericdu1996 发表于 2018-3-19 19:58
bioinformatics里面比较产业化的就是测序相关的了，太偏生物啦，这个在国外的情况不太了解，国内的话就是 ...

好的谢谢！能求种草一些校or项目吗？之前一直在看CB方向的选校

Hazelsuko 发表于 2018-3-19 19:24
但感觉目前四大都在部署computational genomics方向的lab，不知道这块前景如何.....

genomics不太了解(但我觉得学术界很火的东西不一定工业界很火, 学术界火==好发文章, 工业界火==好就业)(LZ可以去关注一下各大公司的研究院的动向? 毕业去公司做算法还是很好的)
为了就业考虑LZ还是申CS吧, 找CS学院下面比较match的老师, 不建议申BME之类的Ph.D.出来真的路比较窄
. 1point 3acres

本人倒是知道一个加州大学BME做影像处理方向的大牛毕业后考进医学院读MD的事例。。。

妇科圣手王发财 发表于 2018-3-19 20:46
本人倒是知道一个加州大学BME做影像处理方向的大牛毕业后考进医学院读MD的事例。。。

这过分励志了23333  我其实主要还是想做一些医学+AI方面的research，暂时还没有考虑强转医学