关于OPT Extension的问题

帮朋友问，如果之前本科的时候OPT employment end date没有及时在学校系统里更新，而且当时实习结束后待在美国的时间超过grace period一点点，之后又申请了master的OPT。现在要用本科的专业申请Stem的话，请问会不会有影响？还有就是之后申请H1B的话会不会有问题，非常感谢。