华盛顿大学UW计算机系远程实习ML/NLP/Comp Bio

各位同学大家好！我将于2021年1月加入华盛顿大学计算机学院成为一名助理教授，这是我的个人主页 web.stanford.edu/~swang91/
我想找愿意和我在暑假期间（从现在开始到9月底）一起做科研的同学来共同完成一些项目。

我的科研方向是open-world biomedical discovery。这是一个高度交叉的新方向，结合了machine learning，nlp，computational biomedicine。未来还会有system的实现和theory的支持。其中还有security，database，hci各个方向的应用。可以说所有cs的方向，甚至科学方向都会用到其中。
如果大家玩过开放世界电脑游戏，比如gta5这种，就一定对open world不陌生了。open world游戏要比closed world游戏更自由，更有趣，但开发起来也更有难度。
我的目标就是开发open world biomedical discovery system。例如我们有一个癌症病人数据集，我们观察到其中80%的病人分别是乳腺癌，肝癌和肺癌。那么当我们用ml model来预测剩下20%的病人的时候，就会by default把剩下的病人也预测成为这三种癌症的一种，但这些病人可能是其他癌症。现实生活中，会因为follow closed world assumption导致大量医疗健康问题，比如罕见疾病，新疾病，新药物都无法进行有效预测和研究。我的科研就是用ml，nlp和comp bio来让科学家医生在open world的环境下做研究，从而让我们能快速的对新疾病、新症状、新药物作出反应。

在这个大背景下，我有一些具体的项目，每个的完成周期是三个月左右。我想找一些对我科研感兴趣的同学，每个人负责一个具体项目，我会努力帮同学们把每个具体项目都变为一个first author paper。

对感兴趣的同学的要求：
1. 能投入大量时间，至少每周40小时，持续2个月-3个月，不会半途而废。如果你愿意投入大量时间，我会相应的投入大量时间指导你，帮你完成这个paper。我会负责选题，帮助你建立ml model和公式推导，帮助你一起写作paper。
2. 有较强编程能力，比如给你一个paper，可以快速把他们的github code跑通，然后改进代码。
3. 数学和ml背景。希望你读过（或者能轻松读懂）Pattern Recognition and Machine Learning这本书。然后能快速读懂一篇新ml/nlp paper（比如MAML，bert）。
4. 生物医学背景不需要。但如果你有这方面背景/兴趣，还有很强的ml能力，那我们可以一起做一个长期项目（1年），然后投一个非常好的期刊（nature 子刊）。也欢迎这样背景的同学来申请我的phd。

你的收获：
1.我没有那种需要同学帮忙的大project，也没有工程开发类的project，每个项目都是冲着投一个好的论文去的。所以每个学生会和我两个人做一个project，然后成为自己paper的first author。如果6月开始和我做实习，我计划10月底投稿。
2. 如果我们合作的愉快，我也会尽我所能帮助你以后的申请。
3. 科研训练。从选题，到ml model，到paper写作，我都会努力指导。所以我很欢迎有很好的数学编程基础，但没有太多科研训练的同学。
4. cutting edge的project。我本人现在在斯坦福医学院读postdoc，所以接触了很多有重大实际意义的生物医学问题（癌症药物开发，新生儿罕见病检测等），我们的科研会以解决这些问题为目标。

如果有兴趣的同学，请把cv，github link，成绩单发给，谢谢！email title: summer internship 我的email swang91 [at] stanford (dot) edu

machecazzo 发表于 2020-6-4 10:18
我现在和很多人一样，处于一个拿着ms的offer但是大概率defer的状态，要是您有半年左右的开发项目，我觉得 ...

关键是我这是不给钱的实习。所以如果做rsearch，学生能发个paper帮助申请研究生，那学生还能接受。

如果是开发性质的，我还不付钱，那就太对不起学生了，我自己也不好意思了。。

請問還招嗎？我是在台灣mscs在讀，明年畢業。2015的時候托福99。目前研究領域偏NLP, GNN, 不過我學什麼都很快。有打算碩士畢業要投美國phd。謝謝

各位同学如果有兴趣，就把相关信息发我email吧。

如果只在这个楼里说下学历背景，我也难以判断，谢谢！

帮楼主顶下。
楼主好，可以给没有达标的同学点关于学习路线的建议吗

补充内容 (2020-6-3 18:09):
有机会可以参与未来的研究

WesleyMo 发表于 2020-6-4 09:08
帮楼主顶下。
楼主好，可以给没有达标的同学点关于学习路线的建议吗

不知道你是什么背景和什么兴趣？

我觉得如果是想学习ml的话，可以先把pattern recognition and machine learning和element of statistical learning读完，再进行具体研究。

会长期招募嘛？比如几个月之后还有机会吗？

Berr 发表于 2020-6-4 09:31
会长期招募嘛？比如几个月之后还有机会吗？

9月以后也可以，但要到时候再说了

机会不错，可惜我现在在外企实习。看8月还有机会的话我投一投。

大一生物，后来转的计算机，其实是对这个方向挺有兴趣的，但是之前上ML课的时候做project，推公式真是太难受了
感觉我这样数学不太好，只会coding的做不来这种……

machecazzo 发表于 2020-6-4 09:55
大一生物，后来转的计算机，其实是对这个方向挺有兴趣的，但是之前上ML课的时候做project，推公式真是太难 ...

其实生物里coding和开发也很重要。做个好的tool比如blast，有大量coding任务。

我也有一些项目是开发的项目。但那些项目需要太多时间投入，包括维护运营，不太适合短期实习。

ai4health 发表于 2020-6-4 10:06
其实生物里coding和开发也很重要。做个好的tool比如blast，有大量coding任务。

我也有一些项目是开发 ...

我现在和很多人一样，处于一个拿着ms的offer但是大概率defer的状态，要是您有半年左右的开发项目，我觉得论坛里可能还是会有不少和我处境类似的人感兴趣想做的

同生物转计算机。
很喜欢这个方向，但ml基础实在太弱。目前拿到ms的offer今年也去不了，现在自己学了一些python web和数据处理的基础，希望老师能捞一手