浅谈生物信息的职业发展规划 from mit

牛叉啊！！！学到差不多够用大概要多久？
我这儿天天为编程能力低下而发愁呢
小K 发表于 2010-12-20 15:50

真的不牛叉阿, 只要你做一些project用到那些语言, 做完project编程水平就差不多了, 不能跟cs的比, 但是生物方面应用就是够用了.

自学的话怎么搞才好呢？
i have a whole bunch of little tools i want to develop but never got around to learning any new language
很多东西上手的时候一头雾水，也不知道哪里去找资料，出了问题也不知道上哪里问

另外R有没有什么refresher course啊？我很担心搞来搞去自己用的总是老一套，新出来的东西也没有学到

自学的话怎么搞才好呢？
i have a whole bunch of little tools i want to develop but never got around to learning any new language
很多东西上手的时候一头雾水，也不知道哪里去找资料，出了问题也不知道上哪 ...
小K 发表于 2010-12-20 16:17

我觉着问问题可能还是得去专业的maillist或者论坛吧, 加一些maillist可能比较有用吧, 大部分问题别人已经问过了, 不发言都能学到很多.  多搜索是最重要的.
如果是想implement一个什么东西, 大部分时候别人已经做过类似的了, 看别人用什么语言就照猫画虎的做个差不多的, 再根据自己的需求extend一下, 多看别人的code可能是比较有用的吧, 不然有时候不知道可以用那个库这个function的, 还在自己琢磨一些很笨的方法, 其实已经有现成的库可以用了, 呵呵

啥是refresher course? R貌似package比较多吧, 层出不穷的, 我基本上就是做之前搜一下有没有现成儿的function可以实现我想要的, 但是没去找过complete package list这种, 也许应该找一下.

哈, 搜了下, 这里就有complete package list.  不过太多太繁杂了... 也没个summary.  可能还是做某个东西之前搜一下相关的package比较方便吧.

quick R 有一些按功能介绍的
wiki有R的分类介绍
http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming
比如我自己其实天天用R，但是用来用去，有时候出了新package也不知道，总是在使用老的函数
然后R里面高级一些的函数，统统的不会用
可能应该到大学课程里面去找找。。。。。
facebook map就超级强大嘛，但是都不清楚人家用了啥函数写的

quick R 有一些按功能介绍的
wiki有R的分类介绍
http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming
比如我自己其实天天用R，但是用来用去，有时候出了新package也不知道，总是在使用老的函数
然后R里面高级一些的函数 ...
小K 发表于 2010-12-20 20:43

大学课程估计也没有新鲜的东西吧, 而且有专门讲这个的课?
facebook那个确实强大, 我也不知道怎么做的, 真是太牛X了~~ 可见R还是有很多东西可以挖掘的啊~

那个wikibook真不错哎, 就是还在developing, 不太全, 以后可以多查查这个.

LS都是读生物信息的么？

大学课程估计也没有新鲜的东西吧, 而且有专门讲这个的课?
facebook那个确实强大, 我也不知道怎么做的, 真是太牛X了~~ 可见R还是有很多东西可以挖掘的啊~
RehsuR 发表于 2010-12-22 13:27

我们系至少从前是有的，还不少，从入门到advanced都有，介绍各种语言拉用法拉，有几个还是创始人直接上课的，TA也都挺牛的，可惜啊，那时候负担超级的重，只上了必修的入门课，还学的个一塌糊涂。其他相关系也有类似的课。机房里还有提供帮助的，学生轮流坐镇。学校里学东西还是快啊，资源丰富。现在自己瞎琢磨，如果不使劲看paper，努力报名培训班，飞速的就凹凸了。

其实还有专门辅导这些东西的网络教程，但是深入点的不容易找，入门的一般就是Quick R, UCLA ATS，不过现在用的上的地方比较少了。
en想明白了，我想问的其实是R by topics and examples，比如wiki book这样的。看来还是有的。

我感觉应该重点做的是两件事情：1.学习统计学，常用的建模、分析方法；2.了解生物问题，以教材为基础泛读最新的论文，对课题有清楚的把握。当然我是计算机的背景，写代码同吃饭感觉一样的，就没必要刻意学了。