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上海交通大学Bio-X研究院毛亚飞课题组招聘博士后

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招生
学校名称: 上海交通大学 Shanghai Jiao Tong University (SJTU)
专业: BioInfo
入学年度: 2022
入学学期: Fall
导师个人主页: https://www.yafmao.org/

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毛亚飞博士已经入职上海交通大学Bio-X研究院担任长聘教轨副教授并建立一个基于三代测序的进化基因组实验室。本课题组现面向国内外公开招聘计算机科学、生物信息学、基因组学、进化生物学和分子生物学博士后科研人员。欢迎大家关注本课题组的工作(https://www.yafmao.org/)。


一、实验室简介

实验室PI毛亚飞本科2014年毕业于南京大学生命科学学院。后于日本冲绳科学技术大学院大学攻读博士学位,师从Noriyuki Satoh教授(日本紫绶褒章获得者)和Evan Economo教授(现任哈佛研究员)学习基因重复和基因树不一致性在进化中的机制。毕业后于2019年加入华盛顿大学Evan Eichler教授(美国科学院和医学院院士)实验室进行博士后研究,主攻结构变异在适应性进化和人类疾病中的生物学机制。主要研究成果包括以第一作者或通讯作者发表在Nature、Nature Methods、Current Biology、iSceince、Molecular Ecology Resources等杂志上,受到同行的广泛关注和引用。详细信息见:https://www.yafmao.org/
在交大Bio-X学院我们将继续致力于研究结构变异,以解答“人类为什么是人类”这一基本生物学问题。结构变异是一类对于基因组影响巨大的遗传变异,常常导致适应性性状的产生或人类遗传疾病。比如Notch2的人类特异性重复导致了人类相对于非人灵长类生物产生更大的大脑,而Notch2的重复基因在人个体中的缺失会导致小脑症。随着三代测序和生物信息学的发展,我们将更加深入的了解结构变异和适应性性状/人类遗传疾病的关系。因此,我们将利用高精度三代测序和自行研发的生物信息学软件来研究灵长类的结构变异,一方面认识人类进化过程中的适应性性状(比如: 人类拥有更大大脑的遗传进化因素),另一方面认识人类遗传疾病产生的进化原因(比如为什么特定基因组片段的重复或缺失会导致人类遗传疾病)。
本实验室PI目前参加了多个国际学术联盟并任相关课题组组长,并与国内外著名实验室有着长期合作,目前拟招聘多名助理研究员和博士后等科研人员。相关合作课题的博士后可以在任期中前往国外课题组交流学习(如:Evan Eichler院士课题组等)。

二、职位简介(助理研究员和博士后各2人)

我们诚挚邀请志同道合的博士毕业生加入我们,用创新的计算算法和生物信息学方法研究灵长类的结构变异。如果你对以下某一领域感兴趣或有相关经验,本课题组将致力于为你提供充分的发展空间和支持。
  • 基因组组装和结构变异鉴定:这项工作是课题组的核心,你将和世界上开发基因组组装和结构变异生物信息学软件的科研人员一起工作,共同探讨完整基因组组装和结构变异鉴定的软件开发和应用。
  • 比较和群体基因组分析:本课题组的目标是解决重要的生物学问题,你将利用高质量的数据来分析比较灵长类的结构变异及其进化,探究结构变异如何导致基因结构和调控的改变,进而产生适应性性状或人类遗传疾病。

除此之外,PI将用自己擅长的基因组学、进化、群体遗传、系统发育等领域的研究经历为你提供力所能及的帮助。对于PI本身不擅长的领域,我们可以一起学习或请教相关领域专家。

三、职位要求

  • 博士后申请人需在相关专业领域已经或即将获得博士学位,作为(并列)第一作者在领域内杂志发表1篇以上研究论文;
  • 在以下任一领域具有研究经验:计算生物学、基因组学、生物信息学、表观遗传学和进化生物学。熟练掌握以下任一技术者优先:软件开发、数据处理、生信和进化分析(熟悉Linux bash和python等);
  • 作为交叉学科实验室,希望你有强烈的学术热情、敢于探索的精神和基本沟通能力;
  • 有较强的专业英语的读写能力,以便和国外团队保持及时的合作联系。
  • 全职在上海交通大学工作,遵守学校各项规章制度。


四、待遇和联系方式

博士后待遇按上海交通大学博士后聘用有关规定执行,享有上海落户、子女优先入学、住房津贴等待遇,年薪至少24万。若入选上海市超级博士后计划或博士后创新人才支持计划,年收入40万以上,且有相应配套科研基金。PI会极力推荐优秀博士后到国内外顶尖实验室学习或参加学术会议。此外,课题组将视情况给予额外绩效奖励。上海交大为优秀博士后提供专有晋升通道。详细请参照上海交通大学有关规定(http://postd.sjtu.edu.cn/index.htm)。

五、应聘材料与联系方式

请附简历,个人陈述(1页,你的科研兴趣以及为何申请本实验室),科研经历综述(1-2页,可用于介绍已发表或未发表成果)并提供至少两位推荐人的姓名、职位和联系方式。对符合条件的申请人我们将安排视频面试。未通过简历筛选的申请人恕不逐一通知。
本启事长期有效。欢迎申请人联系实验室PI:yafmao@gmail.com

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