计算机要不要转生物

younglululu 发表于 2022-09-02 21:46:06
https://www.1point3acres.com/bbs/thread-910394-1-1.html

感谢陆老师，您的招生帖子我盯好久了，只不过最近刚开学还在适应期，稳定下来以后一定给您写邮件争取一个 intern的机会。祝老师一切顺利！

YuanNXVS 发表于 2022-09-02 22:14:38
转bioinformatics不需要有什么顾虑，这个学科的研究课题不仅有趣，phd的日常训练也涵盖（算法，AI，programming, data analysis, technical writin

感谢层主的回复，打消了我很多的顾虑

我是本科生物相关背景，在还行的学校读了个有论文要求的 comp bio 的 ms，有一作论文（论文作者就我和教授两个人，概率建模 + 算法类型的）发表在这个领域内还不错的刊物上，勉强算有点科研经历吧，现在在大厂当后端程序员。

先说结论，不建议。

看到大家的讨论，我感到很奇怪的一点是没有说你是否真的对这个学科感兴趣，似乎只要它的前途足够光明，就值得投以数以年计的时间奔赴。

想象一下你真的取做了这个方向，然后回国找到了教职，这意味着几乎整个职业生涯都要与这个东西打交道，如果对它没有热情的话，这真的是你想要的生活吗？更不要谈以现在高校找教职的内卷程度，没有足够好的文章很难有竞争力。在没有兴趣的情况下，真的能做出好的科研吗？

再说说这个方向的前景，从我读研开始，非常多并没有在这个领域工作过的人和我讲它很有前途，把 CS/Math/Bio 结合起来能做出很棒的研究。可是如果再问他们为什么这么讲，要结合起来解决什么样的问题的时候，他们又说不出个所以然。如果家里的长辈说它有前途，建议问问，这个说法的来源是什么，ta 看到了哪里的潜力，如果只是拍脑袋的想法那其实没啥参考价值。如果只是好发论文灌水那其实也没啥参考价值。

我对这个领域并不悲观，也不认为它是天坑（那种以湿实验为主的是天坑），确实有一些很有趣的方向，比如 DeepMind 做出的 AlphaFold 就很不错嘛。那么问题来了，作为一个没有经验没有背景没有相关知识的人（当然这些可以学），如何判断一个子方向是不是有价值的呢？你可以去顶级的研究机构吗？并不是说一定要想明白这些，看到全貌才能去选择读 PhD，只是如果没有对这些问题的思考就盲目选择的话，是不是对自己太不负责了呢？

去年也有国内大厂的HR找到我，看了我的履历后问我对他们的生物信息/生物大数据研究相关职位是否感兴趣，我就借着这个机会了解了一下，感觉也就那样。很多互联网大厂设立相关研究的小组基本是跟风，同时组里的一些员工选择这个职位的原因仅仅是”讨厌写代码，做这个调参就好”。不过与此同时，一些初创做的事情还挺好玩的，现在这个领域的热钱也多，讲好故事就容易融到资，所以也知道一些背景不错又有水平的人选择加入这些初创公司做有趣的事情。

扯了一大堆有的没的，我建议楼主思考一下自己规划的逻辑是什么样的。

是因为喜欢高校的环境，所以想去高校工作，然后就想找个招人最多最好进高校的方向。还是说我对哪个领域感兴趣，因此愿意将自己时间和精力投入到这个领域的研究里，而高校有不错的环境，所以想去高校工作。在我有限的观察里，一般后者比较容易结果，前者很难，因为没有热情显然很难竞争过有热情的人，这也是我觉得要不要读 PhD，读什么样的 PhD 最重要的考量。

祝好。

补充内容 (2022-09-03 22:09 +8:00):
与其纠结很久不如去了解一下 comp bio 的人在做什么吧。

MIT: https://www.youtube.com/watch?v= ... QwDTo4bIEDV8F4RcAgt

这个内容比较传统（也是我做的）

Stanford DL: https://canvas.stanford.edu/courses/51037

这个是深度学习相关的

linzy310 发表于 2022-09-02 21:55:35
楼上前辈们说的我很赞同 我们算是生物lab 实验室里现在倒是招了几个ee背景 没生物背景的phd 做一些简单的生物实验 大头还在本行 数据分析图像识别这些 具体我没细问 只能说能走吧 比纯生物好 但是

层主在的lab是计算生物吗？还是普通的生物方向啊？我之前也想过投纯生物的实验室，但是担心只做数据处理不做湿实验可能会很难接触到实验室的核心工作，也就打消了念头，放弃纯生物的组只看生信的lab了。

cn20184192 发表于 2022-09-02 22:25:22
层主在的lab是计算生物吗？还是普通的生物方向啊？我之前也想过投纯生物的实验室，但是担心只做数据处理不做湿实验可能会很难接触到实验室的核心工作，也就打消了念头，放弃纯生物的组只看生信的lab了。

算是传统生物lab 只不过比较大 最近新招了一些人做这些更流行一些的方向，我道听途说的是现在生信本身也在卷实验了，找他们的lab的话肯定要找一些有干湿结合的好 我们组这种情况的肯定没那么好

计算生物跟bioinfo都风口了几十年了，怎么还有人觉得这是新领域。灌水容易，真的有影响力科研成果没见着几个。生物是个实验学科，光靠计算机跑跑分析出来些有趣的猜测并不能转化为科学知识

solored 发表于 2022-09-02 22:21:28
我是本科生物相关背景，在还行的学校读了个有论文要求的 comp bio 的 ms，有一作论文（论文作者就我和教授两个人，概率建模 + 算法类型的）发表在这个领域内还不错的刊物上，勉强算有点科研经历吧，

生信可以做很多很有意思的课题，比如 https://db.cngb.org/stomics/artista/，新冠病毒strain测序，rare disease diagnosis/pathogenic variance detection等等。
这个专业career选择权也很高，转码无压力，进退皆宜。

找工作的话计算机更好；找教职的话应该是生物更好吧

生物好玩吗？还是撸电脑好玩啊哥们，别想不开。。。好玩，赚钱，不是特别难，而且还有影响力，你是不是脑子被驴踢？

真没必要 生信的也在转码，次一步选择的在做ds. 大部分生信的也找工作去了，如果不能读cs phd，ms毕业直接swe吧