计算机要不要转生物

是在高级黑生物么

cn20184192 发表于 2022-9-2 23:51
想问一下层主的本科背景是化学还是计算机啊？我看过计算化学方向的招生贴子，大多都写明了需要化学背景， ...

我本科学化工的，博士在化学系下面的计算化学。我觉得只要你有足够的计算机基础，化学生物知识学起来很简单，但是反之很难。从录取角度说，我觉得正常的cs老师/组也不会因为你不懂生物化学知识就直接拒绝你。

补充内容 (2022-09-03 22:26 +8:00):
看了一圈帖子，从我的感觉来说，做bioinfo并不是进退都很简单的。

1. 找教职我从来没考虑过，我知道的几个例子是cs系的话可能phd毕业能直接做ap，但是化学系毕业的话绝对至少一轮postdoc。好的方面是现在AI4science非常火，学术界很喜欢这些东西，如果就想发(水)文章的话还是很简单的，化学口的二区journal及以上并不难，cs口不清楚。

2. 业界的话，首先我不清楚这玩意资本还能烧多少年，并没有见到什么真正落地的东西搞出来，而且pay也远不如码农。如果你能进google brain/deepmind之类的那当我没说...

3. phd毕业走sde/swe，大家一样都得刷题，而且我持疑，不再自己做几个前后端全栈项目的话，怎么和其他人挣一个sde岗？

ps 层主背景，计算化学博士三年多发了八篇文章，明年毕业，刷题1k+，fb扩招去做了sde实习运气好拿了return，艰难上岸，跟学术圈说拜拜

对这方面感兴趣的话可以申请bme或者计算生物学
，我本科是学医的，现在在某码校bme，项目就是AI制药类，只能说本科cs来bme会很抢手，基本上工程方向的导师都会倾向于要cs的学生，楼上说的cs转生物类天坑什么的，其实怎么说呢，你这也不是转生物，至少不可能去做湿实验的，只是把cs,ai的知识应用在生物医学方向上，就像我现在的课题组，根本不需要从生物或者化学的角度来了解蛋白质结构。据我所知我学校bme很多本科国内外名校cs se ee 出来的学生，所以还是得看个人兴趣吧

首先读PhD的前提是你要真的对这个事感兴趣并且愿意持之以恒地all in，否则不要念，浪费时间和生命。 听起来你念phd不是因为你真的对生信感兴趣了，而是听别人说生信是个风口。如果是这种心态不如CS去工业界拿大包。我上大学那会儿都说二十一世纪是生命科学的世纪，现在生化环材学术界是什么生态你可以自己去了解一下。其次就算你真的感兴趣想读生信结合的phd，也不要在生物系念，一定要在CS下念。CS很多教授都拿nih的funding。将来一旦发现自己不适合走学术道路，毕竟还能转码。

說實話感覺LZ的家庭環境非常好，家裡能有做發考題的，但換一個角度看家裡有成就的家長職業分佈有些單一；比如說你的朋友圈有陳省身楊振寧這當然太👍了，不過要是能有馬雲馬化騰，能有姚明李娜武大靖蘇翊鳴，可能你得到的答案會更多元化些，如果親戚中都是一種能人可以嘗試自己在其他領域接觸其他人；當然LZ的研究經歷和對學術的熱愛還是可以認真的看出來，不管選哪個方向成就都不會差

我觉得你这个思路不错,能走通

举一个身边的例子, 小A就是搞生物医学AI的,他AI水平在我看来就是不入流,但这伙计在他们系混的风生水起,一学期就能水两三篇文章.原因在于这个领域懂AI的太少了,随便拿个看似fancy的模型什么XX transformer, XX GNN 往MRI影像之类上面一套,审稿人就被镇住了.现在他们老板都围着他转(这个老板不懂AI但又痴迷AI),他带着同组博士一起发文,征用他们给自己干活,俨然已经是小老板了

地里肯定大多数反对,什么钱多少的,我只能说他们没到这个层次,十几万的SDE就乐得合不拢嘴了.楼主在CV这个领域有文章在投已经算AI入门了,加上家里也有教授,成为第二个小A很有可能.美国去学校当教授也不少挣钱,钱是一回事,稳定性,隐形福利又是另一回事了.而如果同样是找教职,医学AI绝对比CS好找

我是计算生物方向的。楼主你在地里问转生物的问题肯定会有很多劝退你的（非cs相关专业都会遇到类似的情况），毕竟地里的用户还是更偏cs，习惯了高薪和刷题。即使在工业界，生物相关的工作的收入是比不上cs相关的工作的，学术界的收入还有更低一点。我不反对赚钱，但是工资不是衡量职业重要性的唯一标准，我身边有很多人是愿意接受少拿钱去做自己认为重要的工作的。极端一点如果所有人都为了高薪去做软件，那下一次新冠来了大家就只能一起芭比Q了。

如果楼主真的想试试生物信息方向，可以先花时间去了解下目前的研究方向，和领域里的人聊聊。要往学术界走，走得好，对于领域的了解和自己的兴趣是非常重要的，这两个甚至是最重要的因素。楼里的很多帖子比如solored的帖子就有很多相关的信息。

我在一家生物技术公司工作，做生物信息的工作。我自己感觉最近几年尤其是疫情的这两年里，生物技术行业发展的速度是非常快的，有很多很好的公司，生物的创业公司也如雨后春笋。现在经济形势不好，最后能活下来的有多少还未知，但是很多人包括vc都认识到了这个行业的潜力和重要性。楼主你可以考虑从这几个方向来了解这个领域：
1. 楼主你是做CV的，图像处理在生物医疗方面的应用不要太多，生物信息里或者说BME（biomedical engineer）方向有很多和你之间对口的方向。最近比较火的方向是Spatial genomics：空间的信息就是图像，大致是把空间的信息和基因表达（或者其他基因组的信息）结合起来来研究生物学的问题，比如癌症的机制。用AI/DL来分析医疗图像或者做医疗文本的NLP也都是有很多人在做的。
2. AI 制药：这个方向是用AI来辅助药物设计。药厂作药的成本实在是太高了，AI如果能帮助预测有效的化合物，让药厂少走一点弯路，能省出来的钱都是以亿计的。这领域内小一些的公司包括有insitro和recursion bioscience，还有很多大药厂也在自己做。
3. 蛋白：很多人都提到的alphafold及相关的算法，包括meta的蛋白序列的语言模型
4. 癌症：这个方向包含的东西巨多。制药方面热门的有癌症的免疫疗法，靶向药还有下面的ai制药。诊断包括上面提到的医疗图像，基于测序的诊断，液体活检。预防（和治疗）包括癌症疫苗。几乎所有的生物的领域都可以和癌症沾边。
5. 衰老：这个我了解的不多，但是楼主可以关注下calico和最近刚成立然后就花大钱招人的altos lab。
6. RNA疫苗和RNA biology：moderna和biontech的新冠疫苗让这个领域彻底火了，关注这两家公司就可以知道RNA这个领域的很多研究方向了，比如癌症疫苗和RNA辅助的免疫疗法等。
7. 神经科学；老牌领域的，最近和imaging，genomics，免疫还有其他领域结合后又有新的活力。

AppleFans 发表于 2022-09-02 22:04:03
好好刷题，刷题水平一定要比正常的cs master ng的水平好一些，做几个Boot Camp充实简历，有时间学习cs fundamentals，然后投简历找工作。

多谢老哥。主要是我想明年毕业了，之前没计划好，现在正在开始补数据结构和刷题，但是research跟sde完全不相关，也没有去大厂实习，也没时间实习，现在就很发愁简历。。

Felix_hao 发表于 2022-09-03 09:51:53
多谢老哥。主要是我想明年毕业了，之前没计划好，现在正在开始补数据结构和刷题，但是research跟sde完全不相关，也没有去大厂实习，也没时间实习，现在就很发愁简历。。

我当时简历上也是空白，我找了华人办的项目班，算是充实了简历，虽然项目的技术还是不太懂，而且有经验的人一看就是Boot Camp的项目，总比什么都没有好。

我就不说谁家了……Boot Camp还是很多的，华人的，美国人的，你自己Google一下，研究研究。

在这里问，得到的答案就是无脑计算机。这地方非码phd都被鄙视，postdoc就是loser基本不配说话，拿到普通学校教职也被人说死心眼一辈子受穷。所以还能指望有什么建议？无非是千万别读phd，赶紧大厂搞钱。我个人见过一个cs转生物的，n年postdoc，搞出了cns（应该是子刊），后来在美国当教授。建议楼主去木虫或者其他地方问问。如果读phd，个人觉得应该把两件事情分开考虑：读哪个系，做什么方向。计算机系做生物和生物系做计算机，这俩还是有不小区别的。个人愚见，尽量在计算机或相关系做生物，而不要去生物系做计算机。想回国的话，往生物上灌高因子，然后家里帮助走走关系回国，这可能有戏。不过还是那个问题，将来回国还是尽量去信科做教职。楼主的问题应该去木虫多问问。