medical image analysis申请总结（学校推荐，upenn和vandy campus visit以及面经）

Upenn:
campus visit:
upenn BME campus interview总共有三个时间，我这批20人左右，所以总共应该发了60多人。他们把interview过程叫做professor match，一般会过去面2-4个教授，参观实验室，然后教授和学生同时提交志愿，所以被邀请的话录取率就很高了（据说去年发了50多人，未考证）。如果有多个教授要你，开学后可以选择rotation，一般是每个实验室待半个学期，待两个实验室后做出选择。整个campus visit三天，包括program introduction, interviews and lab tour, social event (pub)，happy hours以及dinner with faculty and current grad students，所以还是挺看social能力的。另外还带我们去了费城一个艺术博物馆，以及grad student apartment visit。campus visit的dress code是business casual，大多数人都是正装，但要穿一双好走路的鞋子。我连续去了两个campus visit，精疲力竭。

申请经验：
一起visit的人里面我聊过的本科背景分别来自mit, jhu（大概5人）, cornell, 多大, mcgill, purdue, upenn等，我是其中唯二会说中文的，所以感觉对国际生申请并不怎么友好。陆本的话一定要套磁+牛推。据面试我的教授说，committee给她的pool里几百份申请人资料是没有分类的，而且还不能关键词搜索，她一般都没时间看（她今年缺学生才主动去看了一下）；再加上她在医学院，一般phd申请者可能不会直接发邮件给她，所以她招学生还是挺不容易的，所以实验室主要以postdoc为主。所以套磁和推荐信极其重要！我觉得我是被邀请的人里背景最差的，如果不是教授一路保我，是进不了shortlist的。
关于三维，我觉得其实并不是那么重要。项目要求托福100，我报了deadline前的最后一场，报名距离考试只有2天，而且我之前没考过托福。之前以为自己经常跟外国朋友social聊宗教哲学文化，经常被他们夸英语好于是乎自我膨胀，结果听力时系统故障了一次，口语在规定时间都没说完，最后拿了99这个尴尬的分数。虽然最后没什么影响，但还是强烈建议留足时间，至少所以成绩都过线（个人感觉比如GPA 3.7、3.8+，T100，GRE无所谓被太低就好）。我觉得各因素重要性依次排序是：方向match>推荐信>出身背景>套磁>paper>三维。

面经：
在campus visit前我跟教授和她的postdoc之前有过一个多小时的Skype面试，面试是她前一个晚上提出的，第二天早上面试，所以申请季要随时准备好。面试过程基本都是我在讲之前做过的项目，他们会问细节问题。大概流程是：
1、自我介绍
2、之前项目背景
3、问教授问题
强烈建议面试前做个ppt，这样面试过程基本就在你的掌控之中了。我放了4个项目，分别针对教授做的project可能感兴趣的几个背景方向：neurosicence、医学图像分析、deep learning、医学成像。每个项目做了2页ppt，分为background / motivation，my work 1，my work 2，results四个部分，介绍时只强调我所做的工作以及用到的技能，然后问教授有没有什么其他什么问题。
问教授问题这块就随意了，我问了她对于目前的项目，一两年内希望往哪些方向进行研究。她说完后表明一下我对哪个方向感兴趣，以及提了一些自己的想法和建议，如果我做的话会尝试什么方法，然后大概介绍了一下算法以及为什么用它（其实这块内容我准备过，针对她最近的paper，再看了一些相关领域最新的paper。因为我自己也在这个方向，也就花了一个晚上读paper）。

Vanderbilt:
vandy CS是我master和phd申请时都申请过的学校，也是我非常非常喜欢的一个学校，非常感恩他们都给了我offer。在campus visit后对他们更是喜欢。Nashville这座城市非常干净漂亮，气候也还不错，vandy校园很美。vandy的实验室给我最大的感受是collaborative以及对学生的关怀。imaging方向有几个教授：Bennett、Jack、Ipek、Catie，他们之间关系都挺好，几个实验室都是在同一个走廊旁。phd办公室很新，有非常大的玻璃，阳光很好。同时还有个叫VISE的大实验室，偏medical robotics，里面的人来自各个实验室不同方向，有项目合作时涉及到的人可以搬过去在同个地方工作，方便交流。vandy的工程学院grad students大概500人左右，主要在EECS。读phd的过程中如果你对某个教授或者某个方向更感兴趣，跟你的PI以及对方实验室的教授说一下，一般教授都会欢迎人员流动。imaging方向据Bennett说phd一般4年毕业（如果有master可以3年左右，campus visit时感觉同行的人大部分都有master）。我跟Bennett和ipek实验室的人交流了一下，特别喜欢他们实验室的氛围。Bennet实验室目前大概17人（？），Ipek实验室刚刚起步，人不多，但都特别特别nice，非常热情。给我的总体印象是，vandy是一个可以非常开心的读完phd的地方。

对教授的印象：Bennett是个genius，很有想法又非常热情，有非常crazy的schedule，管理着很大的实验室但又会对每个学生进行指导（不管是grad students还是本科生）。他经常说，他的phd在毕业时会在自己的领域要比他强，他也会往这个方向来push学生（我认为是很positive的push）。他的一个学生跟我说，她觉得在Bennet的实验室下，她做research的过程中感觉很organized，同时实验室的人之间互相学习，会教新来的人。Ipek目前是刚来的AP，对学生很好，很多事情会帮你很体贴的想到，会非常耐心的倾听学生的想法，而且时间上也会比较宽裕些。Ipek性格上非常social人缘好，据说她去conference，结束后一半人都成了她朋友，跟imaging方向的大牛们都有合作。她的学生的评价：在实验室非常开心，很少遇到像ipek那么nice的教授。vandy的话因为我目前实验室跟那边几个教授都很熟悉，所以教授直接联系我了，可能申请经验不太具有参考价值。不过我觉得背景match的申请+认真套磁的话，那边的教授应该会挺重视申请者。

毕业生去向：google，siemens，nvidia，postdoc然后faculty等等。对于要去工业界的人他们会支持实习，也都有connection。Nashville附近工作机会几乎没有（？），出去找的话medical image analysis方向vandy的reputation挺好的。

还有一点不得不提，Vandy CS的小蜜颜值极高，金发碧眼，笑容灿烂甜蜜，热情耐心。实验室里也是好多人长得真赏心悦目。

实验室推荐:
Medical Image Analysis这个方向我熟悉的有名的学校或者实验室有：JHU ECE/BME 的一堆教授, upenn BME Jim Gee、Paul、Christos，UNC CS Stephen、Martin、Marc，MIT EECS Polinda，NYU CS Gerig，Rutgers CS Dimitris，Yale ECE一些lab，还有UVA、Utah、Vandy EECS、WUSTL imaging science等都有一些各有所长的实验室。

Bolin_bme 发表于 2019-3-10 11:09
楼主你好，我也是image analysis方向的，也在申请19fallbme的博士。
请问楼主，毕业想去工业界什么技能比较 ...

不好意思，我实力上还不够，对于这种问题我的想法还很稚嫩。不过在philips时跟research scientist聊天，他们说是读博时期对research技能以及思维能力的锻炼让他们收获最大，对于具体的研究领域反而没有那么重要（他们很多人过来后会从事新的课题，学新的领域）。upenn的postdoc给我的建议是，让我读博时有长期和短期的path。长期path专注于会有impact的研究（比如很少人做的新方向、用具有可解释性的方法，有临床意义和价值），会对科研有真正帮助。短期的path可以把一些所谓fancy的新方法应用在medical上，侧重于会议（学生发这些会议一般对成名的教授来说并不太care，他们可能会觉得不是很好的research，不过可以锻炼工程技能，其中学到的方法可能在工业界会比较受欢迎）。还有我在philips的感受是，在公司你的沟通能力和合作能力会更重要一些，比如四五人一个team做一个项目，公司内也有很多present以及和同事交流，这方面氛围我觉得跟学校内的lab差别比较大。

补充内容 (2019-3-11 06:22):
还有是一般会在senior year找实习？我觉得如果没有工业界背景的话最好有两个以上的实习，可以感受一下不同公司。建议可以跟教授聊聊，问问他们的建议，可能会收获很大。一般好的教授对不同人会有不同的培养模式。

nsc 发表于 2019-4-19 09:33
谢谢lz回复。
排名高的一般好发paper。看他们cs在顶会上发paper很少见，所以想要是读个一般cs phd的话， ...

谢谢。我觉得两块不太一样，做这块的话还会看医学院的排名吧。比如CMU是CS神校，但medical image就感觉并不怎么强；hopkins的eecs并不top，但跟medical沾边的都不弱，vandy也是。如果是读CS，能申到那几所神校phd一般人都不会犹豫去，其次一档的可能看具体老板和实验室吧。我觉得排名对申请master来说可能更有用一些。医学图像这块大家出身的实验室基本都互相数得上来的。bennett挺有名的，特别在我做的这个方向极强，实验室风评也好，至少我不会觉得是一个一般学校的cs phd。会议的话，的确很少去发几个cs的顶会。这块ipmi的认可度挺高的，还有miccai之类，而且我觉得大家还是更认可几个journal，所以用一个评价体系来排名可能会有失偏颇。是否读phd主要还是看各自的规划和学术理想吧，对将来就业的帮助上也要看你怎么定义了。

楼主很厉害 我也是这个方向 但是我这样背景很少的 完全不敢申你申的大多数学校 所以楼主最终会去哪家？

qinxi0117 发表于 2019-3-10 08:57
楼主很厉害 我也是这个方向 但是我这样背景很少的 完全不敢申你申的大多数学校 所以楼主最终会去哪家？

还没决定，二选一吧其他没有更match的。综合男票以及各因素大概率Penn？不过我觉得vandy真特别适合我而且毕业时间短而且CS。打算跟推荐人聊一下问问他们看法。不过会尽快决定，对两边都好。

背景都是慢慢积累起来的，我觉得这个方向申请推荐信很重要（相关实验室暑研或者读master），也看运气。我一开始也很不顺利，还好算有惊无险。一起加油！

qinxi0117 发表于 2019-3-10 08:57
楼主很厉害 我也是这个方向 但是我这样背景很少的 完全不敢申你申的大多数学校 所以楼主最终会去哪家？

还没决定，二选一吧其他没有更match的。综合男票以及各因素大概率Penn？不过我觉得vandy真特别适合我而且毕业时间短而且CS。打算跟推荐人聊一下问问他们看法。不过会尽快决定，对两边都好。

背景都是慢慢积累起来的，我觉得这个方向申请推荐信很重要（相关实验室暑研或者读master），也看运气。我一开始也很不顺利，还好算有惊无险。一起加油！

感谢楼主的信息，好多干货啊！楼主实力也很强！

楼主你好，我也是image analysis方向的，也在申请19fallbme的博士。
请问楼主，毕业想去工业界什么技能比较重要呢，或者读博期间应注重哪些方面的培养呢，谢谢！

Landman 对我们这些没去成 campus visit 的 imaging 学生还安排了个 virtual lab tour。看 Ipek 也会来。确实是很 care 学生了。申其他学校还没听说有这待遇。总之恭喜 lz 拿 upenn 的 offer，感觉应该不会来 Vandy 了吧 。另外 MIT EECS 应该是 Polina？

kaiwen.dev 发表于 2019-3-10 12:08
Landman 对我们这些没去成 campus visit 的 imaging 学生还安排了个 virtual lab tour。看 Ipek 也会来。确 ...

Vandy我是真的觉得特别特别好，教授非常nice，实验室很强，而且3-4年毕业很吸引人啊。upenn那个实验室目前没有phd，几乎全是postdoc，问不了学生的感受，可能那边压力会比较大？不过upenn的project我觉得更有趣，教授人似乎还挺好的，再加上实验室名气的确太吸引人了。所以目前还很难割舍。

补充内容 (2019-3-11 06:12):
哈哈是Polina，刚刚看了一下发帖时好多typo啊hhh

Sherry950512 发表于 2019/03/11 06:00:47


不好意思，我实力上还不够，对于这种问题我的想法还很稚嫩。不过在philips时跟research scientist聊天，他们说是读博时期对research技能以及思维能力的锻炼让他们收获最大，对...

好的，谢谢楼主！感觉我现在做的东西就是把现有的方法用在不同模态的图像上测试结果，也没体验到研究的impact。。有点类似关灌水，希望在博士期间能做出一些新的东西，或者至少能锻炼出你提到的对以后research有帮助的思维能力。不过谢谢你的建议了！