回复加米 陆本 23Fall bioinfo生物信息master/PhD混申求定位

陆本大三生物信息学专业。准备申请生物信息bioinfo的master和PhD（23Fall入学）

课程背景：
生物信息：学过genomics，一些基础的algorithm，和computational modelling，会R，python，Linux。做过一些课程项目，RNA-seq分析，写算法这类的
生物：学过分子生物学，genetics
其他基础课：一学期数学，一学期化学，两学期统计（数理基础薄弱很担心orz）

科研：一段校内科研，单细胞相关，导师没有知名度，但产出了一些数据，学院内导师一般都写强推。在EMBL做过2个月的暑研，protein-protein interaction，导师说会全力支持PhD申请（大概率是强推？）。目前在Cambridge暑研，3D genome，还不明确推荐信强度。在申请的时候不会有pub

GPA：90.13/100，T：104（S23），G：还未考

研究兴趣：cancer genomics，cancer systems biology，immune oncology，总之是基因组学+疾病，偏转化的方向
目前在考虑的一些中等/中等偏上bioinfo的PhD：
BCM-Quantitative & Computational Biosciences
USC-quantitative and computational biology
Penn State-Bioinformatics and Genomics
Boston U-Bioinformatics
UCI-Mathematical, Computational & Systems Biology
UCSC-Biomolecular Engineering & Bioinformatics
Gatech-bioinformatics

想问问这样的背景有希望申请到上面这些学校的PhD吗？

感觉bioinfo的program网上信息好少，不知道program的申请难度，选校好难，欢迎推荐/排雷项目，推荐保底校～
据说有一些biology的PhD program也有很多bioinfo的老师，umbrella program会容易一些，不知道是不是这样?

没有特别坚定要读PhD，背景一般也担心PhD申请结果不好，所以也打算申请一些master：
Harvard medical school-biomedical informatics
Columbia-MA in Biomedical Informatics
weill Cornell-computational biology
umich-computational biology and medicine
CMU-computational biologyBU-Bioinformatics
ETHz-Computational biology and bioinformatics
IC-Bioinformatics and Theoretical Systems Biology

欢迎推荐master项目，要求容易继续读博士的，并且可以补比较多数学和计算机知识的（万一不想继续做科研方便转行）~
真诚求建议，回复加米！







补充内容 (2022-08-21 15:51 +8:00):
ps：只给提供建议/信息的回复加米，刚来论坛米不够TAT

leofu123 发表于 2022-09-17 02:23:55
比较感兴趣癌症+单细胞相关的，或者是多组学数据整合

sanger的Sarah Teichman、Fabian Theis，EPFL的Gioele Manno、Karolinska的Sten Linbarsson、DKFZ的Oliver Stegle、CRG的Roderic Guigo

UW的Cole Trapnell、Jay Shendure，NYU的Rahul Satija、MIT的Aviv Regev、Stanford的Stephen Quake

garbage 发表于 2022-8-21 00:14
请问biomedical informatics是生信吗？为什么看课程简介偏信息管理的感觉？

biomedical informatics和bioinformatics还是有点区别的，有些学校biomedical informatics是偏healthcare和临床诊断的，bioinformatics有很多基础研究

微信用户_2a6xr 发表于 2022-9-16 05:18
可以先定好方向（单细胞、空间组学/癌症、免疫），如果是组学类的我可以推荐一些课题组。

比较感兴趣癌症+单细胞相关的，或者是多组学数据整合

自己顶一下

我也有意向，可否加微信交流

请问biomedical informatics是生信吗？为什么看课程简介偏信息管理的感觉？

微信用户_a0f0442 发表于 2022-8-9 07:26
我也有意向，可否加微信交流

可以，不过我发不出私信哎

可以先定好方向（单细胞、空间组学/癌症、免疫），如果是组学类的我可以推荐一些课题组。